脉冲除尘器一般分成高、低压清灰系统，脉冲除尘器主要以压缩空气作为清灰气源，如果压力或流量不足，清灰力度则不能达到滤袋底部，导致滤袋表面的尘饼不能剥落，形成局部积灰，造成设备阻力增高、滤袋负荷不均匀等现象，缩短滤袋寿命。
反之，如果清灰力度太强，已经渗透进滤料表层的微细颗粒将被打出表面，产生二次扬尘现象。同时，滤袋也可能由于振荡力太强导致与笼架的摩擦过高而裂袋。设备的清灰压力和流量根据系统工艺、粉尘和滤料性质而合理配置。
脉冲除尘器的气布比越高，其阻力比也会相对提高，所以根据滤料的阻力性能，确定用高压力还是大气量进行清灰。目前国内运行的脉冲布袋除尘器以低压清灰为主，压力在0.3MPa以下，并且有渐小的趋势。